Molecules

Nephrin(pY1,pY2,pY3)

Nephrin pY1 pY2 pY3

Nck(S1,S2,S3,Sh2)

Nck S1 S2 S3 Sh2

NWASP(p1,p2,p3,p4,p5,p6)

NWASP p1 p2 p3 p4 p5 p6

Species

Nephrin(pY1,pY2,pY3)

Nephrin pY1 pY2 pY3

Nck(S1,S2,S3,Sh2)

Nck S1 S2 S3 Sh2

NWASP(p1,p2,p3,p4,p5,p6)

NWASP p1 p2 p3 p4 p5 p6

Observables

tot_Nck Nck()

Nck ?S1 ?S2 ?S3 ?Sh2

free_Nck Nck(S1,S2,S3,Sh2)

Nck S1 S2 S3 Sh2

tot_NWASP NWASP()

NWASP ?p1 ?p2 ?p3 ?p4 ?p5 ?p6

free_NWASP NWASP(p1,p2,p3,p4,p5,p6)

NWASP p1 p2 p3 p4 p5 p6

tot_Nephrin Nephrin()

Nephrin ?pY1 ?pY2 ?pY3

free_Nephrin Nephrin(pY1,pY2,pY3)

Nephrin pY1 pY2 pY3

fully_bound_Nephrin Nephrin(pY1!+,pY2!+,pY3!+)

Nephrin pY1 pY2 pY3

fully_bound_Nck Nck(S1!+,S2!+,S3!+,Sh2!+)

Nck S1 S2 S3 Sh2

fully_bound_NWASP NWASP(p1!+,p2!+,p3!+,p4!+,p5!+,p6!+)

NWASP p1 p2 p3 p4 p5 p6

cluster_neph_nck_nw Nephrin().Nck().NWASP()

Nephrin ?pY1 ?pY2 ?pY3 Nck ?S1 ?S2 ?S3 ?Sh2 NWASP ?p1 ?p2 ?p3 ?p4 ?p5 ?p6

cluster_nck_nw Nck().NWASP()

Nck ?S1 ?S2 ?S3 ?Sh2 NWASP ?p1 ?p2 ?p3 ?p4 ?p5 ?p6

Reaction Rules

Nck(S1) + NWASP(p1) <-> Nck(S1!1).NWASP(p1!1)

Nck ⬇⬆S1 ?S2 ?S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ⬇⬆p1 ?p2 ?p3 ?p4 ?p5 ?p6

Nck(S2) + NWASP(p1) <-> Nck(S2!1).NWASP(p1!1)

Nck ?S1 ⬇⬆S2 ?S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ⬇⬆p1 ?p2 ?p3 ?p4 ?p5 ?p6

Nck(S3) + NWASP(p1) <-> Nck(S3!1).NWASP(p1!1)

Nck ?S1 ?S2 ⬇⬆S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ⬇⬆p1 ?p2 ?p3 ?p4 ?p5 ?p6

Nck(S3) + NWASP(p2) <-> Nck(S3!1).NWASP(p2!1)

Nck ?S1 ?S2 ⬇⬆S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ⬇⬆p2 ?p3 ?p4 ?p5 ?p6

Nck(S2) + NWASP(p2) <-> Nck(S2!1).NWASP(p2!1)

Nck ?S1 ⬇⬆S2 ?S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ⬇⬆p2 ?p3 ?p4 ?p5 ?p6

Nck(S1) + NWASP(p2) <-> Nck(S1!1).NWASP(p2!1)

Nck ⬇⬆S1 ?S2 ?S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ⬇⬆p2 ?p3 ?p4 ?p5 ?p6

Nck(S2) + NWASP(p3) <-> Nck(S2!1).NWASP(p3!1)

Nck ?S1 ⬇⬆S2 ?S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ?p2 ⬇⬆p3 ?p4 ?p5 ?p6

Nck(S1) + NWASP(p3) <-> Nck(S1!1).NWASP(p3!1)

Nck ⬇⬆S1 ?S2 ?S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ?p2 ⬇⬆p3 ?p4 ?p5 ?p6

Nck(S3) + NWASP(p3) <-> Nck(S3!1).NWASP(p3!1)

Nck ?S1 ?S2 ⬇⬆S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ?p2 ⬇⬆p3 ?p4 ?p5 ?p6

Nck(S1) + NWASP(p4) <-> Nck(S1!1).NWASP(p4!1)

Nck ⬇⬆S1 ?S2 ?S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ?p2 ?p3 ⬇⬆p4 ?p5 ?p6

Nck(S2) + NWASP(p4) <-> Nck(S2!1).NWASP(p4!1)

Nck ?S1 ⬇⬆S2 ?S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ?p2 ?p3 ⬇⬆p4 ?p5 ?p6

Nck(S3) + NWASP(p4) <-> Nck(S3!1).NWASP(p4!1)

Nck ?S1 ?S2 ⬇⬆S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ?p2 ?p3 ⬇⬆p4 ?p5 ?p6

Nck(S1) + NWASP(p5) <-> Nck(S1!1).NWASP(p5!1)

Nck ⬇⬆S1 ?S2 ?S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ?p2 ?p3 ?p4 ⬇⬆p5 ?p6

Nck(S2) + NWASP(p5) <-> Nck(S2!1).NWASP(p5!1)

Nck ?S1 ⬇⬆S2 ?S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ?p2 ?p3 ?p4 ⬇⬆p5 ?p6

Nck(S3) + NWASP(p5) <-> Nck(S3!1).NWASP(p5!1)

Nck ?S1 ?S2 ⬇⬆S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ?p2 ?p3 ?p4 ⬇⬆p5 ?p6

Nck(S1) + NWASP(p6) <-> Nck(S1!1).NWASP(p6!1)

Nck ⬇⬆S1 ?S2 ?S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ?p2 ?p3 ?p4 ?p5 ⬇⬆p6

Nck(S3) + NWASP(p6) <-> Nck(S3!1).NWASP(p6!1)

Nck ?S1 ?S2 ⬇⬆S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ?p2 ?p3 ?p4 ?p5 ⬇⬆p6

Nck(S2) + NWASP(p6) <-> Nck(S2!1).NWASP(p6!1)

Nck ?S1 ⬇⬆S2 ?S3 ?Sh2 ⬇⬆ NWASP ?p1 ?p2 ?p3 ?p4 ?p5 ⬇⬆p6

Nephrin(pY1) + Nck(Sh2) <-> Nephrin(pY1!1).Nck(Sh2!1)

Nephrin ⬇⬆pY1 ?pY2 ?pY3 ⬇⬆ Nck ?S1 ?S2 ?S3 ⬇⬆Sh2

Nephrin(pY2) + Nck(Sh2) <-> Nephrin(pY2!1).Nck(Sh2!1)

Nephrin ?pY1 ⬇⬆pY2 ?pY3 ⬇⬆ Nck ?S1 ?S2 ?S3 ⬇⬆Sh2

Nephrin(pY3) + Nck(Sh2) <-> Nephrin(pY3!1).Nck(Sh2!1)

Nephrin ?pY1 ?pY2 ⬇⬆pY3 ⬇⬆ Nck ?S1 ?S2 ?S3 ⬇⬆Sh2